AT3G55450.2
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.650 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : PBS1-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PBS1-like 1 (PBL1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: botrytis-induced kinase1 (TAIR:AT2G39660.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20558129..20559963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47348.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 426 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSCLSSRVL STFSTILHLP FFFFFFFFPF FGVLSILTVV NAFVCCADKS SSGLDDLHLS SCKSSSSATA HKTEGEILSS TTVKSFSFNE LKLATRNFRS 101: DSVVGEGGFG CVFRGWLDET TLTPTKSSSG LVIAVKRLNP DGFQGHREWL TEINYLGQLS HPNLVKLIGY CLEDEQRLLV YEFMHKGSLE NHLFANGNKD 201: FKPLSWILRI KVALDAAKGL AFLHSDPVKV IYRDIKASNI LLDSDFNAKL SDFGLARDGP MGEQSYVSTR VMGTFGYAAP EYVSTGHLNA RSDVYSFGVV 301: LLELLCGRQA LDHNRPAKEQ NLVDWARPYL TSRRKVLLIV DTRLNSQYKP EGAVRLASIA VQCLSFEPKS RPTMDQVVRA LVQLQDSVVK PANVDPLKVK 401: DTKKLVGLKT EDKYQRNGLN KKTVGL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)