AT3G52560.4
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ubiquitin E2 variant 1D-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ubiquitin E2 variant 1D-4 (UEV1D-4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Ubiquitin-conjugating enzyme, E2 (InterPro:IPR000608); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MMS ZWEI homologue 3 (TAIR:AT2G36060.2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19494678..19495954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18590.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 164 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLGSGGSSV VVPRNFRLLE ELERGEKGIG DGTVSYGMDD GDDIYMRSWT GTIIGPHNIM PLLLLLVVTE INFMSQTVHE GRIYQLKLFC DKDYPEKPPT 101: VRFHSRVNMA CVNHETGVVD PKKFGLLANW QREYTMEDIL VQLKKEMSTS HNRKLVQPPE GTCF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)