AT1G17745.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D-3-phosphoglycerate dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a 3-Phosphoglycerate dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: D-3-phosphoglycerate dehydrogenase (InterPro:IPR006236), D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain (InterPro:IPR006139), D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR006140), D-3-phosphogylcerate Dehydrogenase (InterPro:IPR015508), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-3-phosphoglycerate dehydrogenase (TAIR:AT4G34200.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6101157..6104979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69737.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 651 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFSSSCSSV KAVNSRWTSP SPSPSSRFAV LPAFLHRRYA TSVKLTAISA ALKTVEQTTL TEDNRFSTVG SDSDEYNPTL PKPRILVTEK LGEAGVNLLR 101: EFGDVDCSYD LSPEDLKKKV AESDALIVRS GTKVTREVFE AAKGRLKVVG RAGVGIDNVD LQAATEHGCL VVNAPTANTV AAAEHGIALL ASMARNVAQA 201: DASIKAGTLN YLFLVLLLRW NCRQSKHQYT IETETEKRSK YVGVSLVGKT LAVMGFGKVG TEVARRAKGL GMTVISHDPY APADRARALG VDLVSFDQAI 301: STADFVSLHM PLTPATKKVF NDETFSKMKK GVRLINVARG GVIDEDALVR ALDAGIVAQA ALDVFCEEPP SKDSRLIQHE NVTVTPHLGA STKEAQEGVA 401: IEIAEAVAGA LKGELSATAV NAPMVAPEVL SELTPYIVLA EKLGRLAVQL ASGGKGVQSI RVVYRSARDR DDLDTRLLRA MITKGIIEPI SDSYVNLVNA 501: DFIAKQKGLR ISEERMVVDS SPEYPVDSIQ VQILNVESNF AGAVSDAGDI SIEGKVKYGV PHLTCVGSFG VDVSLEGNLI LCRQVDQPGM IGQVGNILGE 601: QNVNVNFMSV GRTVLRKQAI MAIGVDEEPD NKTLERIGGV SAIEEFVFLK L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)