AT1G03910.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cactin protein, cactus-binding domain, C-terminal (InterPro:IPR019134), Cactin, central region (InterPro:IPR018816); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G36815.2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:996432..1000231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83438.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 716 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSHGKGKRD RSGRQKKRRD ESESGSESES YTSDSDGSDD LSPPRSSRRK KGSSSRRTRR RSSSDDSSDS DGGRKSKKRS SSKDYSEEKV TEYMSKKAQK 101: KALRAAKKLK TQSVSGYSND SNPFGDSNLT ETFVWRKKIE KDVHRGVPLE EFSVKAEKRR HRERMTEVEK VKKRREERAV EKARHEEEMA LLARERARAE 201: FHDWEKKEEE FHFDQSKVRS EIRLREGRLK PIDVLCKHLD GSDDLDIELS EPYMVFKKKK VRIGIWLNFQ LSITNVYVEA EYKNDSACLL LRSRVDILLN 301: KGLTVKDMEE LRDDIKMYLD LDRATPTRVQ YWEALIVVCD WELAEARKRD ALDRARVRGE EPPAELLAQE RGLHAGVEAD VRKLLDGKTH AELVELQLDI 401: ESQLRSGSAK VVEYWEAVLK RLEIYKAKAC LKEIHAEMLR RHLHRLEQLS EGEDDVEVNP GLTRVVEENE EEINDTNLSD AEEAFSPEPV AEEEEADEAA 501: EAAGSFSPEL MHGDDREEAI DPEEDKKLLQ MKRMIVLEKQ KKRLKEAMDS KPAPVEDNLE LKAMKAMGAM EEGDAIFGSN AEVNLDSEVY WWHDKYRPRK 601: PKYFNRVHTG YEWNKYNQTH YDHDNPPPKI VQGYKFNIFY PDLVDKIKAP IYTIEKDGTS AETCMIRFHA GPPYEDIAFR IVNKEWEYSH KKGFKCTFER 701: GILHLYFNFK RHRYRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)