AT3G26410.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.865 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : methyltransferases;nucleic acid binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyltransferases;nucleic acid binding; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity, nucleic acid binding; INVOLVED IN: methylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative RNA methylase (InterPro:IPR000241), tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase, TRM11 (InterPro:IPR016691), DNA methylase, N-6 adenine-specific, conserved site (InterPro:IPR002052); Has 597 Blast hits to 588 proteins in 280 species: Archae - 150; Bacteria - 5; Metazoa - 158; Fungi - 132; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9669508..9671273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54641.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 477 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWFLCVFYHR LLDFRKPEVE ALAELFGEEI AENESLQWRL PENHHNDTPF HFVQLSSEEI ARNIAKRSIL VKGMYELWGE GTCYEELKDS IQSYPDSRKL 101: PFLTSDSTFR ISVETFGKAL TFDEQKDRIQ SFTYIPFEGR VNLKNPDHNF FLMEMIESEE NNGLQPILQR RIFFGREVGF ADRKLLPTFQ LKSRTYLGPT 201: AMDAEMAFLM ANQAKATSGK LVYDPFVGTG SILVSAARFG AMTMGADIDI RVVRDGRGPD CNVWSNFKQY GLPMPVALLR MDNNVPPWRS GLKEIFDAII 301: CDPPYGVRAG GRKSGGRKIL RGTVDPYTVP DDKRTDHIPS TGAYSLVECV HDLLHLAARM LVMKGRLVFF FPVLRDETGS EVKFPEHPCF KLVAVSEQIL 401: SSRYSRVLLT MVKVEPYSEE VEEAARLMHL EFRENHLKWL EDGNIHSSIF KPIDSSQIDT DSKAFKDPKP KYRGKYV |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)