AT1G17560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L14p/L23e family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Mutant shows abnormal ovule development | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HUELLENLOS (HLL); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, intracellular, large ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L14, bacterial-type (InterPro:IPR005745), Ribosomal protein L14b/L23e (InterPro:IPR000218), Ribosomal protein L14 conserved site (InterPro:IPR019972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L14p/L23e family protein (TAIR:AT5G46160.2); Has 9401 Blast hits to 9401 proteins in 3194 species: Archae - 306; Bacteria - 5487; Metazoa - 280; Fungi - 278; Plants - 760; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2290 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6037635..6038574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21161.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATALASKLS KGRSLLGGLC NAFSGLMNSS SNGMMNGSIL SQQQHRTFIQ MGTILKCVDN SCAKEVMCIQ SLRGKKGARL GDIIVGSVKE ANPIVQKKVK 101: KDAIPKGKVK KGMVVYGVVV RAAMPKGRAD GSQVKFDDNA IVVVGIKEKK GQNNSHGSKR KMEYNQPTGT RVFGPVPHEM RLRKQLKILS LAQHIV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)