AT5G47850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CRINKLY4 related 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CRINKLY4 related 4 (CCR4); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II (InterPro:IPR009091), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CRINKLY4 related 3 (TAIR:AT3G55950.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:19378803..19381058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83778.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 751 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALTISISCF SSYFVSLLLL VLSSFSFVCF SLSTVSISHI SNQTLVCALN NHSYLQCSSF PLNSIPFSLT GNLRNRRFSG VVSGNGFVCG LISRLDSNTS 101: TLLCWRFSVD GTNMLHKRIY HGPELEELEA GNFRICGVER VSRRLRCWQP YYLPRPDNYR SIALGDNFFC GLSQPPGMIS CEGIAKVPSG DHYIAIAAGS 201: RQACAITVDN DVECWGQTQS LPREKFLALA VGEDRGCGVR WSNGTVVCWG NNNNFSLPQT LKDIHFTSIY AKGPMFCGVA TRNYTLICWG NENFKSGVFT 301: PFQGLISQVV MPGPCRRECP YRPLSGSQSL CGNELMICDL KRNDGEFPDT RAQNSKNKTW SRRNIAFLVV GCVGTFSLLL VISFLIFKSH CRCRVHDSGR 401: LDDTRTIDIP KLEKRLCTLA SLGNPGQLME FSIDELALAT DGFSVRFHLG IGSFGSVYQG VLSDGRHVAI KRAELTNPTL SGTTMRHRRA DKDSAFVNEL 501: ESMSRLNHKN LVRLLGFYED TEERILVYEY MKNGSLADHL HNPQFDPLSW QTRLMIALDA ARGIQYLHEF IVPPVIHRDI KSSNILLDAT WTAKVSDFGL 601: SQMGPTEEDD VSHLSLHAAG TLGYIDPEYY KFQQLTTKSD VYSFGVVLLE LLSGHKAIHN NEDENPRNLV EYVVPYILLD EAHRILDQRI PPPTPYEIEA 701: VAHVGYLAAE CLMPCSRKRP SMVEVVSKLE SALAACLTAP KTETVSRSNT Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)