AT5G37475.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Translation initiation factor eIF3 subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Translation initiation factor eIF3 subunit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Translation initiation factor eIF3 subunit (InterPro:IPR013906); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Translation initiation factor eIF3 subunit (TAIR:AT1G66070.2); Has 416 Blast hits to 416 proteins in 166 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 171; Fungi - 133; Plants - 80; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:14866328..14867749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25169.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDDWEAEDFQ PLPSKVELKS NWDDEDVDEN DIKDSWEEED VSAPPPIVKP ASEKAPKKPA VKAVEKKVKT VEAPKGTSRE EPLDPIAEKL RMQRLVEEAD 101: YQSTAELFGV KTEEKSVDML IPKSESDFLD YAELISQRLV PFEKSFHYIG LLKAVMRLSV ANMKAADVKD VASSITAIAN EKLKAEKEAA AGKKKSGKKK 201: QLHVDKPDDD LVSGPYDAMD DDDFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)