AT5G24840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.744 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : tRNA (guanine-N-7) methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
tRNA (guanine-N-7) methyltransferase; FUNCTIONS IN: tRNA (guanine-N7-)-methyltransferase activity; INVOLVED IN: acetate biosynthetic process from carbon monoxide, methanol oxidation, tRNA modification; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: tRNA (guanine-N-7) methyltransferase (InterPro:IPR003358); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: tRNA (guanine-N-7) methyltransferase (TAIR:AT5G17660.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8533897..8534652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28819.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 251 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDNETKATTF SKSTGLPRKR FYRARAHSNP LSDSHFPIPI SPAHVDYSLH FPKFVEADNK FIKKVEFADI GCGFGGLLIS LATLFPDTLM IGMELRDKVT 101: EYVKERILAL RRTSSEGQYE NISVVRTNSM KYIPNYFEKG QLSKMFFLFP DPHFKEKNHR RRVISTHLLD EYAYVLRAGG IIYTITDVEE LGEWMKSCLE 201: KHPMFESLTQ EELVSDPVVE LLCSATEEGQ KVARNGGQTF RAVFRRIAYV S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)