AT4G36010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thaumatin, pathogenesis-related (InterPro:IPR001938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein (TAIR:AT2G17860.1); Has 1622 Blast hits to 1597 proteins in 186 species: Archae - 0; Bacteria - 48; Metazoa - 58; Fungi - 84; Plants - 1413; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17039472..17040976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30907.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 301 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGQSQVSLFL LLILVFIYGV SSTTFTIVNQ CSYTVWPGLL SGAGTSPLPT TGFSLNPTET RVIPIPAAWS GRIWGRTLCT QDATTGRFTC ITGDCGSSTV 101: ECSGSGAAPP ATLAEFTLNG ANGLDFYDVS LVDGYNIPMT IVPQGGGDAG GVAGNCTTTG CVAELNGPCP AQLKVATTGA EGVACKSACE AFGTPEYCCS 201: GAFGTPDTCK PSEYSQFFKN ACPRAYSYAY DDGTSTFTCG GADYVITFCP SPNPSVKSAT KGVQPVAVSY SKASPNASPT LSAVFSIGVL AVASWVMQRV 301: L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)