AT4G29430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein S15A E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein S15A E (rps15ae); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: mitochondrion, cytosolic small ribosomal subunit, cytosolic ribosome, vacuole; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S8 (InterPro:IPR000630); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ribosomal protein S15A B (TAIR:AT2G19720.1); Has 3554 Blast hits to 3554 proteins in 1296 species: Archae - 277; Bacteria - 1753; Metazoa - 425; Fungi - 219; Plants - 281; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 599 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14472440..14473383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14917.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 129 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRRILNDAL RTIVNAERRG KASVELKPIS TVMSSFLRIM KEKGYIKNFQ VYDPHRVGRI TVDLQGRVND CKALTYRQDV RAKEIEKYTE RTLPTRQWGY 101: VVITTPDGIL DHEEAIKRNV GGQVLGFFY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)