AT4G21110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G10 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
G10 family protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: G10 protein (InterPro:IPR001748), BUD31/G10-related, conserved site (InterPro:IPR018230); Has 466 Blast hits to 466 proteins in 208 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 189; Fungi - 126; Plants - 80; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 71 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11267673..11268774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17187.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPKVKTNRVK YPEGWELIEP TLRELDAKMR EAETDSHDGK RKCETLWPIF KVSHQRSRYV YDLYYRREEI SKELYEFCLD QGYADRSLIA KWKKSGYERL 101: CCLRCIQPRD HNYGTTCVCR VPKHLREEKV VECVHCGCQG CASGD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)