AT4G13050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Acyl-ACP thioesterase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Acyl-ACP thioesterase; FUNCTIONS IN: acyl carrier activity; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl-ACP thioesterase (InterPro:IPR002864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fatA acyl-ACP thioesterase (TAIR:AT3G25110.1); Has 1268 Blast hits to 1268 proteins in 529 species: Archae - 0; Bacteria - 942; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 319; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7617739..7619355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42233.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKLSCNVTD HIHNLFSNSR RIFVPVHRQT RPISCFQLKK EPLRAILSAD HGNSSVRVAD TVSGTSPADR LRFGRLMEDG FSYKEKFIVR SYEVGINKTA 101: TIETIANLLQ EVACNHVQNV GFSTDGFATT LTMRKLHLIW VTARMHIEIY KYPAWSDVVE IETWCQSEGR IGTRRDWILK DCATGEVIGR ATSKWVMMNQ 201: DTRRLQRVTD EVRDEYLVFC PPEPRLAFPE ENNSSLKKIP KLEDPAQYSM LGLKPRRADL DMNQHVNNVT YIGWVLESIP QEIIDTHELK VITLDYRREC 301: QQDDIVDSLT TSETPNEVVS KLTGTNGSTT SSKREHNESH FLHILRLSEN GQEINRGRTQ WRKKSSR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)