AT3G63120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin p1;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cyclin p1;1 (CYCP1;1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Negative regulatory factor PREG (InterPro:IPR012389), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin-related 2 (InterPro:IPR013922), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin p4;1 (TAIR:AT2G44740.1); Has 1179 Blast hits to 1177 proteins in 221 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 258; Fungi - 438; Plants - 231; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 234 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:23323143..23323893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25432.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 221 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSLATDPAF IDSDVYLRLG LIIEGKRLKK PPTVLSRLSS SLERSLLLNH DDKILLGSPD SVTVFDGRSP PEISIAHYLD RIFKYSCCSP SCFVIAHIYI 101: DHFLHKTRAL LKPLNVHRLI ITTVMLAAKV FDDRYFNNAY YARVGGVTTR ELNRLEMELL FTLDFKLQVD PQTFHTHCCQ LEKQNRDGFQ IEWPIKEACR 201: ANKETWQKRT PDSLCSQTTA R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)