AT3G62680.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : proline-rich protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Proline-rich protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
proline-rich protein 3 (PRP3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pollen Ole e 1 allergen/extensin (InterPro:IPR006041); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proline-rich protein 1 (TAIR:AT1G54970.1); Has 50468 Blast hits to 23098 proteins in 1486 species: Archae - 263; Bacteria - 8049; Metazoa - 18736; Fungi - 5929; Plants - 9093; Viruses - 1757; Other Eukaryotes - 6641 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:23182778..23183819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34418.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 313 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAITRSSLAI CLILSLVTIT TADYYSPSSP PVYKSPEHKP TLPSPVYTPP VYKPTLSPPV YTKPTIPPPV YTPPVYKHTP SPPVYTKPTI PPPVYTPPVY 101: KPTLSPPVYT KPTIPPPVYT PPVYKPTPVY TKPTIPPPVY TPPVYKPTPS PPVYKKSPSY SSPPPPYVPK PTYTPTTKPY VPEILKAVDG IILCKNGYET 201: YPILGAKIQI VCSDPASYGK SNTEVVIYSN PTDSKGYFHL SLTSIKDLAY CRVKLYLSPV ETCKNPTNVN KGLTGVPLAL YGYRFYPDKN LELFSVGPFY 301: YTGPKAAPAT PKY |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)