AT3G59790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.972 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 10 (MPK10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: JNK MAP kinase (InterPro:IPR008351), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 6 (TAIR:AT2G43790.1); Has 123160 Blast hits to 121852 proteins in 4728 species: Archae - 108; Bacteria - 13196; Metazoa - 46727; Fungi - 12540; Plants - 29650; Viruses - 470; Other Eukaryotes - 20469 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22092448..22094240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45176.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPTNDAETL ETQGEVTTAI WPSSQILKTT IDIPGTLSHD GRYIQYNLFG HIFELPAKYK PPIRPIGRGA CGIVCSAVDS ETNEKVAIKK ITQVFDNTIE 101: AKRTLREIKL LRHFDHENIV AIRDVILPPQ RDSFEDVYIV NELMEFDLYR TLKSDQELTK DHGMYFMYQI LRGLKYIHSA NVLHRDLKPS NLLLSTQCDL 201: KICDFGLARA TPESNLMTEY VVTRWYRAPE LLLGSSDYTA AIDVWSVGCI FMEIMNREPL FPGKDQVNQL RLLLELIGTP SEEELGSLSE YAKRYIRQLP 301: TLPRQSFTEK FPNVPPLAID LVEKMLTFDP KQRISVKEAL AHPYLSSFHD ITDEPECSEP FNFDLDEHPF SEEQFRELIY CEALAFNPET SND |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)