AT3G50930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome BC1 synthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome BC1 synthesis (BCS1); FUNCTIONS IN: nucleoside-triphosphatase activity, ATPase activity, nucleotide binding, ATP binding; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, conserved site (InterPro:IPR003960); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT3G50940.1); Has 21434 Blast hits to 19763 proteins in 2733 species: Archae - 1352; Bacteria - 7111; Metazoa - 3538; Fungi - 2773; Plants - 2474; Viruses - 30; Other Eukaryotes - 4156 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18929817..18931547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66139.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 576 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGSKLLPCV HKSPVPTSHQ LYINYEILGL TKLKKHKYTQ NKMSSSDSSS AESRLATAKT VLTTAASVAA TAMLARSLVQ DYLPDEVHHY ISYGFRSIFG 101: YFSSQMTIII EEFEGFAHNE VFEAAEAYLA TKISPSNKRI KVSKHEKENN YNVTVERDEE VVDTYNGVKF QWILHCRHVE SKHFHNPRDL NSTLRSEVRS 201: FELNFHKKFK DVALESYLPF MVKRATLMKQ EKKTLKIFTL SPENMYGNYS DAWTSVTLDH PSTFKTLAMD SDVKTSVMED LDKFVKRRDF YKRVGKAWKR 301: GYLLYGPPGT GKSSLIAAMA NHLNFDIYDL ELTAVNNNSE LRRLLIATAN RSILIVEDID CSLELKDRTS DEPPRESDDI EDPRYKKVTL SGLLNFIDGL 401: WSSCGDERII IFTTNYKEKL DAALLRPGRM DMHIHMSYCT PSTFKALALN YLEIKEHRLF SKIEEGIEAT EVTPAEVAEQ LMRNDSVDKV LEGLIEFLKV 501: KKIENEQDKA KTEKQELENK KKTKEGTDSV VKKEVDEQLV RNDRVDKVLE GLVELLKAKK IEDDQDKAKH EEVEQH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)