AT3G46010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : actin depolymerizing factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Actin-depolymerizing factor (ADF) and cofilin define a family of actin-binding proteins essential for the rapid turnover of filamentous actin in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
actin depolymerizing factor 1 (ADF1); FUNCTIONS IN: actin binding; INVOLVED IN: actin filament organization; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Actin-binding, cofilin/tropomyosin type (InterPro:IPR002108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: actin depolymerizing factor 4 (TAIR:AT5G59890.1); Has 1496 Blast hits to 1495 proteins in 266 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 633; Fungi - 166; Plants - 513; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 181 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16909679..16910678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16113.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 139 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANAASGMAV HDDCKLRFLE LKAKRTHRFI VYKIEEKQKQ VVVEKVGQPI QTYEEFAACL PADECRYAIY DFDFVTAENC QKSKIFFIAW CPDIAKVRSK 101: MIYASSKDRF KRELDGIQVE LQATDPTEMD LDVFRSRAN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)