AT3G44735.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PHYTOSULFOKINE 3 PRECURSOR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Phytosulfokine 3 precursor, coding for a unique plant peptide growth factor. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PHYTOSULFOKINE 3 PRECURSOR (PSK3); FUNCTIONS IN: growth factor activity; INVOLVED IN: cell proliferation; LOCATED IN: endomembrane system, extracellular region; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phytosulfokine (InterPro:IPR009438); Has 79 Blast hits to 79 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16291388..16292118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 9292.13 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 81 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MKQSLCLAVL FLILSTSSSA IRRGKEDQEI NPLVSATSVE EDSVNKLMGM EYCGEGDEEC LRRRMMTESH LDYIYTQHHK H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)