AT3G25400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.863 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NTP Pyrophosphohydrolase MazG-related, RS21-C6 (InterPro:IPR011394), EAR (InterPro:IPR009039), NTP pyrophosphohydrolase MazG, putative catalytic core (InterPro:IPR004518); Has 1123 Blast hits to 1121 proteins in 452 species: Archae - 22; Bacteria - 753; Metazoa - 81; Fungi - 3; Plants - 83; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 181 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9213236..9214144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15820.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 141 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNKGEEGGED KEVVSLQTLS KKMDDFAKAR DWEKYHSPRN LLLAMVGEVG ELSEIFQWKG EVARGCPDWK EEEKVHLGEE LSDVLLYLVR LSDACGVDLG 101: KAALRKIELN AIKYPVPKKT DDHCVGDGED SSSKIKLNEE N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)