AT3G19820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cell elongation protein / DWARF1 / DIMINUTO (DIM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in the conversion of the early brassinosteroid precursor 24-methylenecholesterol to campesterol. Brassinosteroids affect cellular elongation. Mutants have dwarf phenotype. DWF1 is a Ca2+-dependent calmodulin-binding protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DWARF 1 (DWF1); FUNCTIONS IN: calmodulin binding, catalytic activity; INVOLVED IN: response to light stimulus, steroid biosynthetic process, unidimensional cell growth, brassinosteroid biosynthetic process; LOCATED IN: integral to membrane, plasma membrane, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD-linked oxidase, FAD-binding, subdomain 2 (InterPro:IPR016168), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), FAD linked oxidase, N-terminal (InterPro:IPR006094); Has 2747 Blast hits to 2744 proteins in 657 species: Archae - 35; Bacteria - 1665; Metazoa - 178; Fungi - 472; Plants - 176; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 221 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6879835..6881616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65397.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 561 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSDLQTPLVR PKRKKTWVDY FVKFRWIIVI FIVLPFSATF YFLIYLGDMW SESKSFEKRQ KEHDENVKKV IKRLKGRDAS KDGLVCTARK PWIAVGMRNV 101: DYKRARHFEV DLGEFRNILE INKEKMTARV EPLVNMGQIS RATVPMNLSL AVVAELDDLT VGGLINGYGI EGSSHIYGLF ADTVEAYEIV LAGGELVRAT 201: RDNEYSDLYY AIPWSQGTLG LLVAAEIRLI KVKEYMRLTY IPVKGDLQAL AQGYIDSFAP KDGDKSKIPD FVEGMVYNPT EGVMMVGTYA SKEEAKKKGN 301: KINNVGWWFK PWFYQHAQTA LKKGQFVEYI PTREYYHRHT RCLYWEGKLI LPFGDQFWFR YLLGWLMPPK VSLLKATQGE AIRNYYHDMH VIQDMLVPLY 401: KVGDALEWVH REMEVYPIWL CPHKLFKQPI KGQIYPEPGF EYENRQGDTE DAQMYTDVGV YYAPGCVLRG EEFDGSEAVR RMEKWLIENH GFQPQYAVSE 501: LDEKSFWRMF NGELYEECRK KYRAIGTFMS VYYKSKKGRK TEKEVREAEQ AHLETAYAEA D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)