AT3G10050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : L-O-methylthreonine resistant 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
first enzyme in the biosynthetic pathway of isoleucine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
L-O-methylthreonine resistant 1 (OMR1); FUNCTIONS IN: L-threonine ammonia-lyase activity; INVOLVED IN: isoleucine biosynthetic process, threonine metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Threonine dehydratase I (InterPro:IPR005787), Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit (InterPro:IPR001926), Threonine dehydratase, C-terminal (InterPro:IPR001721), Serine/threonine dehydratase, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR000634); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine racemase (TAIR:AT4G11640.1); Has 26917 Blast hits to 26860 proteins in 2759 species: Archae - 692; Bacteria - 18712; Metazoa - 552; Fungi - 889; Plants - 577; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 5493 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3099164..3101741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64638.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 592 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSVQLPTAQ SSLRSHIHRP SKPVVGFTHF SSRSRIAVAV LSRDETSMTP PPPKLPLPRL KVSPNSLQYP AGYLGAVPER TNEAENGSIA EAMEYLTNIL 101: STKVYDIAIE SPLQLAKKLS KRLGVRMYLK REDLQPVFSF KLRGAYNMMV KLPADQLAKG VICSSAGNHA QGVALSASKL GCTAVIVMPV TTPEIKWQAV 201: ENLGATVVLF GDSYDQAQAH AKIRAEEEGL TFIPPFDHPD VIAGQGTVGM EITRQAKGPL HAIFVPVGGG GLIAGIAAYV KRVSPEVKII GVEPADANAM 301: ALSLHHGERV ILDQVGGFAD GVAVKEVGEE TFRISRNLMD GVVLVTRDAI CASIKDMFEE KRNILEPAGA LALAGAEAYC KYYGLKDVNV VAITSGANMN 401: FDKLRIVTEL ANVGRQQEAV LATLMPEKPG SFKQFCELVG PMNISEFKYR CSSEKEAVVL YSVGVHTAGE LKALQKRMES SQLKTVNLTT SDLVKDHLRY 501: LMGGRSTVGD EVLCRFTFPE RPGALMNFLD SFSPRWNITL FHYRGQGETG ANVLVGIQVP EQEMEEFKNR AKALGYDYFL VSDDDYFKLL MH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)