AT2G21490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydrin LEA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dehydrin LEA (LEA); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to water, response to stress; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, sepal, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dehydrin (InterPro:IPR000167); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dehydrin family protein (TAIR:AT4G39130.1); Has 1372 Blast hits to 1173 proteins in 160 species: Archae - 0; Bacteria - 7; Metazoa - 17; Fungi - 21; Plants - 1314; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9206209..9207040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19299.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 185 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADLRDEKGN PIHLTDTQGN PIVDLTDEHG NPMYLTGVVS STPQHKESTT SDIAEHPTST VGETHPAAAP AGAGAATAAT ATGVSAGTGA TTTGQQHHGS 101: LEEHLRRSGS SSSSSSEDDG QGGRRKKSIK EKIKEKFGSG KHKDEQTPAT ATTTGPATTD QPHEKKGILE KIKDKLPGHH NHNHP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)