AT1G76990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ACT domain repeat 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ACT domain repeat 3 (ACR3); FUNCTIONS IN: amino acid binding; INVOLVED IN: nitrogen compound metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein-PII uridylyltransferase (InterPro:IPR010043), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ACT domain repeat 4 (TAIR:AT1G69040.2); Has 3451 Blast hits to 2026 proteins in 630 species: Archae - 0; Bacteria - 2210; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 524; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 717 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28933387..28935179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50405.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 453 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKVYWPYFD PEYENLSSRI NPPSVSIDNT SCKECTLVKV DSMNKPGILL EVVQVLTDLD LTITKAYISS DGGWFMDVFH VTDQQGNKVT DSKTIDYIEK 101: VLGPKGHASA SQNTWPGKRV GVHSLGDHTS IEIIARDRPG LLSEVSAVLA DLNINVVAAE AWTHNRRIAC VLYVNDNATS RAVDDPERLS SMEEQLNNVL 201: RGCEEQDEKF ARTSLSIGST HVDRRLHQMF FADRDYEAVT KLDDSASCGF EPKITVEHCE EKGYSVINVS CEDRPKLMFD IVCTLTDMQY IVFHATISSS 301: GSHASQEYFI RHKDGCTLDT EGEKERVVKC LEAAIHRRVS EGWSLELCAK DRVGLLSEVT RILREHGLSV SRAGVTTVGE QAVNVFYVKD ASGNPVDVKT 401: IEALRGEIGH SMMIDFKNKV PSRKWKEEGQ AGTGGGWAKT SFFFGNLLEK LLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)