AT1G76560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CP12 domain-containing protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CP12 domain-containing protein 3 (CP12-3); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: negative regulation of reductive pentose-phosphate cycle; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function CP12 (InterPro:IPR003823); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CP12 domain-containing protein 1 (TAIR:AT2G47400.1); Has 242 Blast hits to 242 proteins in 66 species: Archae - 0; Bacteria - 121; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 114; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28728285..28728689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15449.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 134 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MISGSATASH GRVLLPSQRE RRPVSTGSNI LRFRETVPRQ FSLMMVTKAT AKYMGTKMRE EKLSEMIEEK VKEATEVCEA EEMSEECRVA WDEVEEVSQA 101: RADLRIKLKL LNQDPLESFC QENPETDECR IYED |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)