AT1G65260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plastid transcriptionally active 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein required for thylakoid membrane formation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
plastid transcriptionally active 4 (PTAC4); INVOLVED IN: vesicle organization, thylakoid membrane organization; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PspA/IM30 (InterPro:IPR007157); Has 3123 Blast hits to 3108 proteins in 1139 species: Archae - 38; Bacteria - 2412; Metazoa - 160; Fungi - 68; Plants - 89; Viruses - 95; Other Eukaryotes - 261 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24236329..24240428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36394.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 330 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALKASPVTG LFPPLRPTAS SSPSTSSNRP CSLRILPLRT SFFGNSSGAL RVNVLRLACD NRLRCNGHGA TMNLFERFSR VVKSYANALI SSFEDPEKIL 101: EQTVIEMNSD LTKMRQATAQ VLASQKQLQN KYKAAQQSSD DWYKRAQLAL AKGDEDLARE ALKRRKSFAD NATALKTQLD QQKGVVDNLV SNTRLLESKI 201: QEAKAKKDTL LARARTAKTA TKVQEMIGTV NTSGALSAFE KMEEKVMAME SEADALTQIG TDELEGKFQM LETSSVDDDL ADLKKELSGS SKKGELPPGR 301: STVAASTRYP FKDSEIENEL NELRRKANDF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)