AT1G64980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has 703 Blast hits to 703 proteins in 58 species: Archae - 0; Bacteria - 90; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 45; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 564 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24137840..24138619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30217.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 259 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTISNGDVKS ETCNNGSSEK KPFRIFVGYD PREDLAYQVC HHSITKRSSI PVEITPIIQS DLRKKGLYWR ERGQLESTEF SFSRFLTPHL SDYQGWAMFV 101: DCDFLYLADI KELTDLIDDK YAIMCVQHDY TPKETTKMDG AVQTVYPRKN WSSMVLYNCG HPKNKTLSPE IVNTQTGAFL HRFQWLEDEE IGSIPFVWNF 201: LEGHNRVVEK DPTTQPKAVH YTRGGPWFDA WKDCEFADLW LNEMEEYNKE NKKEADNAK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)