AT1G48520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GLU-ADT subunit B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B (from Genbank record AF239836). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GLU-ADT subunit B (GATB); FUNCTIONS IN: glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing) activity, carbon-nitrogen ligase activity, with glutamine as amido-N-donor, ligase activity; INVOLVED IN: glutamyl-tRNA aminoacylation, translation; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit B, conserved site (InterPro:IPR017958), Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, B subunit (InterPro:IPR004413), Aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B-related (InterPro:IPR003789), Aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase, subunit B /E (InterPro:IPR017959), Asn/Gln amidotransferase (InterPro:IPR018027), Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit B/E, N-terminal (InterPro:IPR006075); Has 9064 Blast hits to 8884 proteins in 2422 species: Archae - 562; Bacteria - 4430; Metazoa - 127; Fungi - 129; Plants - 54; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3762 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:17940185..17942540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60944.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 550 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTTLLRTIQ LNQFSLLGTS LLRRRRSNNF SVRSCGSQTT TTHEAKQSSP TRVAPKNHKS NQLDEILRDY EAVIGIETHV QLSTLTKAFC SCSNNYGSYP 101: NTSICPVCMG LPGALPVLNS KVVEFGVRLG LALNCDLSLK SKFDRKQYFY PDLPKGYQIS QFDIPIASGG YVDVDIPLEF GGGHRRFGIT RVHMEEDAGK 201: LLHSDTGDYS QVDLNRAGVP LLEIVSEPDM RSGIEAAEYA CEMQRIARYL GVSNGNMQEG SLRCDVNISI RPIGQAEFGT KVEIKNLNAF SAISRAIDFE 301: ISRQALLYNQ GKADQIVTET RLWEEGAQKT VTMRKKEGLA DYRYFPEPDL PEVILTQEYV DSIRASLPEL PEAKRRRYEA MGLGMQDVLF LANDVSVAEY 401: FDAVIGKGAE VKLAANWIMS DIAAYLKNEK LSINDIKLTP QELAELIAAI KDGTISGKIG KEILFELLAK GGTVKGMIKA KDLVQITDPA EIEKMVIQVV 501: SENPKQLEQY RSGKTKLQGY FAGQVMKMSK GKANPGLLNK ILLEKLNAKD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)