AT1G17455.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.998 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : ELF4-like 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ELF4-like 4 (ELF4-L4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1313 (InterPro:IPR009741); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ELF4-like 2 (TAIR:AT1G72630.1); Has 149 Blast hits to 148 proteins in 34 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 148; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5997932..5998276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12663.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 114 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGDVLSGFG DRHNMDGKLL QSFQKSFVDV QDILDQNRLL INEINQNHES KQPDNLGRNV GLIKELNNNI RRVASLYGDL SHSFARSVDA SSEGESSGTL 101: KSDGKANQKR FRSG |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)