AT1G10500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chloroplast-localized ISCA-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in chloroplast Fe-S cluster assembly. Located in the chloroplast stroma. Expressed preferentially in green tissues. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chloroplast-localized ISCA-like protein (CPISCA); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FeS cluster insertion, C-terminal, conserved site (InterPro:IPR017870), FeS cluster biogenesis (InterPro:IPR000361), FeS cluster insertion (InterPro:IPR016092); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Iron-sulphur cluster biosynthesis family protein (TAIR:AT5G03905.1); Has 10385 Blast hits to 10384 proteins in 1842 species: Archae - 43; Bacteria - 5944; Metazoa - 237; Fungi - 240; Plants - 172; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3749 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3460160..3461340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19338.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 180 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFATGITTS SNPTFLGLKI SNTSLRSVVS CNSISFPSLS YVNLNLNRRN RLSVRSASVP AAPAMEGLKP AISLSENALK HLSKMRSERG EDLCLRIGVK 101: QGGCSGMSYT MDFENRANAR PDDSTIEYQG FTIVCDPKSM LFLFGMQLDY SDALIGGGFS FSNPNATQTC GCGKSFAAEM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)