AT5G65800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental)  :max.
SUBAcon:cytosol 0.987 What is SUBAcon? What is ASURE? SUBAcon computations |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ACC synthase 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (ACS) is encoded by a multigene family consisting of at least five members whose expression is induced by hormones, developmental signals, and protein synthesis inhibition. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ACC synthase 5 (ACS5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (InterPro:IPR001176), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR004838), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 9 (TAIR:AT3G49700.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26331096..26332698 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53315.80 Da | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.72 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 470 amino acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKQLSTKVTS NGHGQDSSYF LGWEEYEKNP YDEIKNPNGM IQMGLAENQL CFDLIESWLT KNPDAASLKR NGQSIFRELA LFQDYHGMPE FKKAMAEFME 101: EIRGNRVTFD PKKIVLAAGS TSANETLMFC LAEPGDAFLL PTPYYPGFDR DLKWRTGAEI VPIHCSSSNG FQITESALQQ AYQQAQKLDL KVKGVLVTNP 201: SNPLGTALTR RELNLLVDFI TSKNIHLISD EIYSGTMFGF EQFISVMDVL KDKKLEDTEV SKRVHVVYSL SKDLGLPGFR VGAIYSNDEM IVSAATKMSS 301: FGLVSSQTQY LLSALLSDKK FTSQYLEENQ KRLKSRQRRL VSGLESAGIT CLRSNAGLFC WVDMRHLLDT NTFEAELDLW KKIVYNVKLN ISPGSSCHCT 401: EPGWFRVCFA NMSEDTLDLA LKRLKTFVES TDCGRMISRS SHERLKSLRK KTVSNWVFRV SWTDRVPDER |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)