AT2G45200.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.444 endoplasmic reticulum 0.240 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : golgi snare 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the GOS1 (Golgi SNARE) gene family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
golgi snare 12 (GOS12); FUNCTIONS IN: SNARE binding; INVOLVED IN: cellular membrane fusion, intra-Golgi vesicle-mediated transport; LOCATED IN: cytosol, integral to membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: golgi snare 11 (TAIR:AT1G15880.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18637689..18639640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28523.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 257 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTESSLDLQE SGWEELRREA RKIEGDLDVK LSSYAKLGAR FTQGDTDLVM NYEKVLKCVL VSGYVDTGSP TVGSGRSWKS MEMEIQSLLE KLLDINDSMS 101: RCAASAAPTT SVTQKLARHR DILHEYTQEF RRIKGNINSL REHAELLSSV RDDISEYKAS GSMSPGVQVL RERASIHGSI SHIDDVIGQA QATRAVLGSQ 201: RSLFSDVQGK VKNLGDKFPV IRGLLGSIKR KRSRDTLILS AVIAACTLFL IIYWLSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)