AT1G68020.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.964 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase / trehalose-phosphatase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme putatively involved in trehalose biosynthesis. The protein has a trehalose synthase (TPS)-like domain and a trehalose phosphatase (TPP)-like domain. It can complement a yeast mutant lacking both of these activities suggesting that this is a bifunctional enzyme. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATTPS6; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), Glycosyl transferase, family 20 (InterPro:IPR001830), Trehalose-phosphatase (InterPro:IPR003337); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: trehalose phosphatase/synthase 5 (TAIR:AT4G17770.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25497493..25500241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97708.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 860 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSRSYSNLL ELASGDSPTF GRMNRQIPRI MAVAGIMSNI DNDSKDTDLS PKDRIIIVAN ELPIRAQRRV DGNGSGSSSS STCCSKGWNF SWDENSLLLQ 101: LKDGLGDEAI EVIYVGCLKE EIPLNEQEEV YQILLESFKC VPTFLPLDLY TRYYHGFCKQ QLWPLFHYML PLSPDLGGRF DRTLWQAYVS VNKIFADRIM 201: EVINPEDDFV WIHDYHLMVL PTFLRKRFNR VKLGFFLHSP FPSSEIYKTL PIREELLRAL LNSDLIGFHT FDYARHFLSC CSRMLGLTYE SKRGYIGLEY 301: YGRTVSIKIL PVGIHMGQLQ SVLSLPETER KVGELIERYG RKGRTMLLGV DDMDIFKGIT LKLLAMEQLL MQHPEWQGKV VLVQIANPAR GKGKDVKEMQ 401: AETYSTVKRI NETFGRPGYD PIVLIDAPLK FYERVAYYVV AECCLVTAVR DGMNLIPYEY IVSRQGNEKL DKILKLEANN RNKKSMLVVS EFIGCSPSLS 501: GAIRVNPWNV DAVADAMDSA LEVAEPEKQL RHEKHYKYVS THDVGYWARS FLQDLERSCG EHGRRRCWGI GFGLSFRVVA LDQSFRKLSM EHIVSAYKRT 601: KTRAILLDYD DTLMPQGSID KRPSSKSIDI LNTLCRDKGN LVFIVSAKSR ETLSDWFSPC EKLGIAAEHG YFLRLRKAVE WENCVAAVDC SWKQIAEPVM 701: ELYTETTDGS TIEDKETALV WSYEDADPDF GSCQAKELLD HLESVLANEP VTVKRGQNYV EVKPQGVSKG LIARRMLSMM QERGTLPEFV LCIGDDRSDE 801: DMFEVICSST EGPSIAPRAE IFACTVGQKP SKAKYYLDDT TEIVRLMHGL ASVTDQITPV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)