AT1G10310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a NADPH-dependent pterin aldehyde reductase that accepts pterin aldehyde as well as dihydropterin aldehyde as substrates involved in metabolism and salvage of folate and its derivatives. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (InterPro:IPR020904), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose/ribitol dehydrogenase (InterPro:IPR002347), Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (InterPro:IPR002198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (TAIR:AT3G55290.2); Has 116138 Blast hits to 115933 proteins in 3618 species: Archae - 897; Bacteria - 77623; Metazoa - 6898; Fungi - 5998; Plants - 2845; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 21875 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3381733..3383874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25319.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 242 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTMATPFSGA ANSIVAARTV LITGVSKGLG RALALELAKR GHTVIGCARS QEKLTALQSE LSSSTNHLLL TADVKSNSSV EEMAHTIVEK KGVPDIIVNN 101: AGTINKNSKI WEVSAEDFDN VMDTNVKGVA NVLRHFIPLM LPRKQGIIVN MSSGWGRSGA ALVAPYCASK WAIEGLSRAV AKEVVEGMAV VALNPGVINT 201: ELLTSCFGNS ASLYQAPDAW AVKAATMILN LTAGDNGGSL TV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)