AT4G28580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transport 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. Functions in pollen development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium transport 5 (MGT5); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 6 (TAIR:AT3G58970.1); Has 828 Blast hits to 824 proteins in 200 species: Archae - 0; Bacteria - 80; Metazoa - 59; Fungi - 196; Plants - 383; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 110 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14123489..14125003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46023.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSLRRSTSN RSRKKGTAVK MNRMPSSLSP PTPPCSAIVG GTGKSKKRRG GVCLWTRFDR TGFMEVAGCD KSTIIERSSV SAKDLRTAFS HSSKILAREK 101: AIVLNLEVIK AVITSEQVML LDSLRPEVLT LTDRLKHHFP RKDGPENILQ ASSHGHQEGG EEGLKSKLPF EFRVLEIAFE VFCSFVDSNV VDLETQAWSI 201: LDELTKKVSN ENLKDLRSLK TSLTHLLARV QKVRDEIEHF LDDKEDMEDL YLTRKWIQNQ QTEAASNSIV SQPNLQRHTS NRISTSMVTE EDDIDDMEML 301: LEAYFMQLEG MRNKILLMKE HIDSTEAYVK ILQNSRRNGL IHLMMLVNIG NYAITAGTVV VNLFGMNIPI GLYSTPDIFG YVVWAVVALC IVLFIVTVGY 401: AKWKKLLD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)