AT4G12720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.920 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MutT/nudix family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with ADP-ribose hydrolase activity. Negatively regulates EDS1-conditioned plant defense and programmed cell death. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NUDT7; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: in 8 processes; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase, conserved site (InterPro:IPR020084), Nudix hydrolase 6-like (InterPro:IPR003293), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 6 (TAIR:AT2G04450.1); Has 1663 Blast hits to 1661 proteins in 413 species: Archae - 2; Bacteria - 838; Metazoa - 192; Fungi - 6; Plants - 162; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 462 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7487716..7489557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31886.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 282 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTRAQQIPL LEGETDNYDG VTVTMVEPMD SEVFTESLRA SLSHWREEGK KGIWIKLPLG LANLVEAAVS EGFRYHHAEP EYLMLVSWIS ETPDTIPANA 101: SHVVGAGALV INKNTKEVLV VQERSGFFKD KNVWKLPTGV INEGEDIWTG VAREVEEETG IIADFVEVLA FRQSHKAILK KKTDMFFLCV LSPRSYDITE 201: QKSEILQAKW MPIQEYVDQP WNKKNEMFKF MANICQKKCE EEYLGFAIVP TTTSSGKESF IYCNADHAKR LKVSRDQASA SL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)