ATCG00720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosynthetic electron transfer B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the cytochrome b(6) subunit of the cytochrome b6f complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosynthetic electron transfer B (PETB); FUNCTIONS IN: heme binding; INVOLVED IN: photosynthesis, light reaction; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, cytochrome b6f complex, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b/b6 (InterPro:IPR016175), Di-haem cytochrome, transmembrane (InterPro:IPR016174), Cytochrome b/b6, N-terminal (InterPro:IPR005797); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: apocytochrome b (TAIR:ATMG00220.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:+:74841..76292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24154.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 215 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKVYDWFEE RLEIQAIADD ITSKYVPPHV NIFYCLGGIT LTCFLVQVAT GFAMTFYYRP TVTEAFASVQ YIMTEANFGW LIRSVHRWSA SMMVLMMILH 101: VFRVYLTGGF KKPRELTWVT GVVLGVLTAS FGVTGYSLPW DQIGYWAVKI VTGVPDAIPV IGSPLVELLR GSASVGQSTL TRFYSLHTFV LPLLTAVFML 201: MHFLMIRKQG ISGPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)