AT5G64840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : general control non-repressible 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of GCN subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
general control non-repressible 5 (GCN5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, conserved site (InterPro:IPR017871); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABC transporter family protein (TAIR:AT5G09930.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25916956..25919693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 78005.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 692 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLSTNLHSL DLRSTFFTGL RTSPIPSNFI KISSISNPRR DISTIRAQVS TISLETSVKQ RQDEIESLFS KQPSQQDSDR KRNGKSSKNG ASGISSGVKL 101: ENIRKSYKGV TVLKDVTWEV KRGEKVGLVG VNGAGKTTQL RIITGQEEPD SGNVIKAKPN MKVAFLSQEF EVSMSKTVRE EFMTAFKEEM EITEKLEKVQ 201: KAIEGSVDDL DLMGRLLDEF DLLQRRAQAV NLDSVDAKIS KLMPELGFAP EDADRLVASF SGGWQMRMSL GKILLQDPDL LLLDEPTNHL DLDTIEWLEG 301: YLQKQDVPMV IISHDRAFLD QLCTKIVETE MGVSRTFEGN YSQYVISKAE WIETQNAAWE KQQKDIDSTK DLIARLGAGA NSGRASTAEK KLEKLQEQEL 401: IEKPFQRKQM KIRFPERGTS GRSVVNVKNI DFGFEDKMLF KKANLSIERG EKIAILGPNG CGKSTLLKLI MGLEKPVKGE VILGEHNVLP NYFEQNQAEV 501: LDLDKTVLET VCEAAEDWRS DDIKGLLGRC NFKADMLDRK VSLLSGGEKA RLAFCKFMVT PSTLLVLDEP TNHLDIPSKE MLEEAINEYQ GTVIAVSHDR 601: YFIKQIVNRV IEVEDGCLED YAGDYNYYLE KNLDARTKEL EREAELEEKA PKVKAKSKMS KAEKEARKKQ KMQAFQQAKQ KSKASKNSKR WN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)