AT4G09350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Chaperone DnaJ-domain superfamily protein; FUNCTIONS IN: heat shock protein binding; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Heat shock protein DnaJ, conserved site (InterPro:IPR018253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein (TAIR:AT1G80030.2); Has 22215 Blast hits to 22211 proteins in 3226 species: Archae - 172; Bacteria - 9488; Metazoa - 3742; Fungi - 1942; Plants - 2004; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 4859 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:5931317..5932152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28497.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 249 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAYATSTYAR TSCIILPKIQ NGAHFTDDTK AFRRITARRV TRIYASQGPT KPSKPSPGVD TRIHWESPDE GWIGGRSDPA KSVDEDKTNL LSDEKFAELI 101: KDSFDSHYQF LGVSTDADLE EIKSAYRRLS KEYHPDTTSL PLKTASEKFM KLREVYNVLS DEETRRFYDW TLAQEVASRQ AEKMRMKLED PKEQDFRGYE 201: SIPDMVDRLG GRNMELSDQA MTALTFDILI VLFAVCCIAF VIVFKDPSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)