AT3G56380.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
response regulator 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
response regulator 17 (RR17); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CheY-like (InterPro:IPR011006), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 16 (TAIR:AT2G40670.1); Has 39813 Blast hits to 39289 proteins in 2430 species: Archae - 260; Bacteria - 34490; Metazoa - 15; Fungi - 615; Plants - 1410; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 3017 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20905480..20906368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 16863.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 153 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNKGCGSGSD SCLSSMEEEL HVLAVDDNLI DRKLVERILK ISSCKVTTAE NGLRALEYLG LGDPQQTDSL TNVMKVNLII TDYCMPGMTG FELLKKVKES 101: SNLKEVPVVI LSSENIPTRI NKCLASGAQM FMQKPLKLSD VEKLKCHLLN CRS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)