AT3G04530.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 0.676 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a second Arabidopsis phosphoenolpyruvate carboxylase kinase gene product with a different expression pattern from PPCK1. Expression of the gene is upregulated by exposure of the plant to light. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 2 (PPCK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 1 (TAIR:AT1G08650.1); Has 120539 Blast hits to 118552 proteins in 3545 species: Archae - 165; Bacteria - 14785; Metazoa - 43114; Fungi - 13204; Plants - 27915; Viruses - 518; Other Eukaryotes - 20838 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1221546..1222456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 31200.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 278 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTREFELENN YQLCDEIGRG RFGTITRCFS PATKEFYACK TIDKRVLIDA LDRECIETEP RIMAMLPPHP NIIRIFDLYE TEDSLAIVME LVDPPMTIYD 101: RLISAGGRLS ESESASYAKQ ILSALAHCHR CDVVHRDVKP DNVLVDLVSG GVKLCDFGSA VWLGGETAEG VVGTPYYVAP EVVMGRKYDE KVDIWSAGVV 201: IYTMLAGEPP FNGETAEDIF ESILRGNLRF PPKKFGSVSS EAKDLLRKMI CRDVSRRFSA EDALRHSWMM NVGNLQSN |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)