AT2G22810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.554 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
key regulatory enzyme in the biosynthesis of the plant hormone ethylene. ACS4 is specifically induced by indoleacetic acid (IAA). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 4 (ACS4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (InterPro:IPR001176), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR004838), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 1-amino-cyclopropane-1-carboxylate synthase 8 (TAIR:AT4G37770.1); Has 28174 Blast hits to 28171 proteins in 2873 species: Archae - 784; Bacteria - 19102; Metazoa - 651; Fungi - 724; Plants - 1302; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5611 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9717791..9719472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53798.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 474 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVQLSRKATC NSHGQVSSYF LGWEEYEKNP YDVTKNPQGI IQMGLAENQL CFDLLESWLA QNTDAACFKR DGQSVFRELA LFQDYHGLSS FKNAFADFMS 101: ENRGNRVSFD SNNLVLTAGA TSANETLMFC LADPGDAFLL PTPYYPGFDR DLKWRTGVEI VPIQSSSTNG FRITKLALEE AYEQAKKLDL NVKGILITNP 201: SNPLGTTTTQ TELNILFDFI TKNKNIHLVS DEIYSGTVFN SSEFISVMEI LKNNQLENTD VLNRVHIVCS LSKDLGLPGF RVGAIYSNDK DVISAATKMS 301: SFGLVSSQTQ YLLSSLLSDK KFTKNYLREN QKRLKNRQRK LVLGLEAIGI KCLKSNAGLF CWVDMRPLLR SKTFEAEMDL WKKIVYEVKL NISPGSSCHC 401: EEPGWFRVCF ANMIDETLKL ALKRLKMLVD DENSSRRCQK SKSERLNGSR KKTMSNVSNW VFRLSFHDRE AEER |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)