AT2G15370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.844 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Predicted fucosyltransferase, based on similarity to FUT1, but not functionally redundant with FUT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 5 (FUT5); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: cell wall biogenesis; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: cauline leaf, flower, root, seed; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 4 (TAIR:AT2G15390.2); Has 338 Blast hits to 329 proteins in 19 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 332; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6698100..6699783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61176.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 533 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYQKFQISGK IVKTLGLKMK VLIAVSFGSL LFILSYSNNF NNKLLDATTK VDIKETEKPV DKLIGGLLTA DFDEGSCLSR YHKYFLYRKP SPYKPSEYLV 101: SKLRSYEMLH KRCGPDTEYY KEAIEKLSRD DASESNGECR YIVWVAGYGL GNRLLTLASV FLYALLTERI ILVDNRKDVS DLLCEPFPGT SWLLPLDFPM 201: LNYTYAWGYN KEYPRCYGTM SEKHSINSTS IPPHLYMHNL HDSRDSDKLF VCQKDQSLID KVPWLIVQAN VYFVPSLWFN PTFQTELVKL FPQKETVFHH 301: LARYLFHPTN EVWDMVTDYY HAHLSKADER LGIQIRVFGK PDGRFKHVID QVISCTQREK LLPEFATPEE SKVNISKTPK LKSVLVASLY PEFSGNLTNM 401: FSKRPSSTGE IVEVYQPSGE RVQQTDKKSH DQKALAEMYL LSLTDNIVTS ARSTFGYVSY SLGGLKPWLL YQPTNFTTPN PPCVRSKSME PCYLTPPSHG 501: CEADWGTNSG KILPFVRHCE DLIYGGLKLY DEF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)