AT1G74480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RWP-RK domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RWP-RK domain-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant regulator RWP-RK (InterPro:IPR003035); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RWP-RK domain-containing protein (TAIR:AT1G18790.1); Has 474 Blast hits to 470 proteins in 45 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3; Fungi - 7; Plants - 395; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 69 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27993032..27994178 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33889.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 298 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADHTTKEQK SFSFLAHSPS FDHSSLSYPL FDWEEDLLAL QENSGSQAFP FTTTSLPLPD LEPLSEDVLN SYSSASWNET EQNRGDGASS EKKRENGTVK 101: ETTKKRKINE RHREHSVRII SDITTYTTSS APTTLSKETV SRYFYMPITQ AAIALNVGLT LLKRRCRELG IRRWPHRKLM SLNTLISNVK ELQKMEGEEN 201: AEKLQDALEM LEKEKRTIED LPDLEFKDKT KRLRQACFKA NHKRKKKRSL KSDQSQVPSC SSSGSVPSDE SVDEAGMESD EEMKYLLCGF SSEFTSGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)