AT1G54410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.973 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydrin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dehydrin family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to water, response to stress; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has 604 Blast hits to 498 proteins in 128 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 151; Fungi - 65; Plants - 159; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20310305..20310601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10796.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 98 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MAGLINKIGD ALHIGGGNKE GEHKKEEEHK KHVDEHKSGE HKEGIVDKIK DKIHGGEGKS HDGEGKSHDG EKKKKKDKKE KKHHDDGHHS SSSDSDSD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)