AT1G24360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; FUNCTIONS IN: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (InterPro:IPR011284), Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (InterPro:IPR020904), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose/ribitol dehydrogenase (InterPro:IPR002347), Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (InterPro:IPR002198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (TAIR:AT2G29370.1); Has 133396 Blast hits to 132816 proteins in 3924 species: Archae - 1008; Bacteria - 83642; Metazoa - 7884; Fungi - 7548; Plants - 3127; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 30182 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8640820..8643283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33550.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 319 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAAVAAPRL ISLKAVAKLG FREISQIRQL APLHSAIPHF GMLRCRSRQP FSTSVVKAQA TATEQSPGEV VQKVESPVVV ITGASRGIGK AIALALGKAG 101: CKVLVNYARS AKEAEEVAKQ IEEYGGQAIT FGGDVSKATD VDAMMKTALD KWGTIDVVVN NAGITRDTLL IRMKQSQWDE VIALNLTGVF LCTQAAVKIM 201: MKKKRGRIIN ISSVVGLIGN IGQANYAAAK GGVISFSKTA AREGASRNIN VNVVCPGFIA SDMTAELGED MEKKILGTIP LGRYGKAEEV AGLVEFLALS 301: PAASYITGQA FTIDGGIAI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)