AT1G17530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase of inner mitochondrial membrane 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a translocase of inner mitochondrial membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase of inner mitochondrial membrane 23 (TIM23-1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim23 (InterPro:IPR005681), Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim17/22 (InterPro:IPR003397); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: translocase inner membrane subunit 23-2 (TAIR:AT1G72750.1); Has 791 Blast hits to 791 proteins in 192 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 393; Fungi - 198; Plants - 139; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 61 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6027723..6028286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19975.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 187 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAINRSSDHE SDENTRLYHP YQNYQVPIKS QYLYKLPTSP EFLFTEESLK QRRSWGENLT FYTGTGYLAG SVAGASAGIF SGIKSFENGD TTKLKINRIL 101: NSSGQAGRTW GNRVGIVGLI YAGIESGVVA VTDKDDVWTS VVAGLGTGAV FRAARGVRSA AVAGAFGGIA AGAVVAGKQV FKRYAHI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)