AT1G16260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Wall-associated kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Wall-associated kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Wall-associated kinase family protein (TAIR:AT1G79670.1); Has 123075 Blast hits to 119967 proteins in 4481 species: Archae - 119; Bacteria - 13868; Metazoa - 46954; Fungi - 10147; Plants - 33759; Viruses - 489; Other Eukaryotes - 17739 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5559708..5562018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81164.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 720 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVDVKRFLV VMLLLRICEY AAASTFPLAL RNCSDHCGNV SVPYPFGIGK GCYKNKWFEI VCKSSSDQQP ILLLPRIRRA VTSFNLGDPF SISVYNKFYI 101: QSPLKHSGCP NRDGYSSSSL NLKGSPFFIS ENNKFTAVGC NNKAFMNVTG LQIVGCETTC GNEIRSYKGA NTSCVGYKCC QMTIPPLLQL QVFDATVEKL 201: EPNKQGCQVA FLTQFTLSGS LFTPPELMEY SEYTTIELEW RLDLSYMTSK RVLCKGNTFF EDSYQCSCHN GYEGNPYIPG GCQDIDECRD PHLNKCGKRK 301: CVNVLGSYRC EKTWPAILSG TLSSGLLLLI FGMWLLCKAN RKRKVAKQKR KFFQRNGGLL LQQQTSFLHG SVNRTKVFSS NDLENATDRF NASRILGQGG 401: QGTVYKGMLE DGMIVAVKKS KALKEENLEE FINEIILLSQ INHRNVVKIL GCCLETEVPI LVYEFIPNRN LFDHLHNPSE DFPMSWEVRL CIACEVADAL 501: SYLHSAVSIP IYHRDVKSTN ILLDEKHRAK VSDFGISRSV AIDDTHLTTI VQGTIGYVDP EYLQSNHFTG KSDVYSFGVL LIELLTGEKP VSLLRRQEVR 601: MLGAYFLEAM RNDRLHEILD ARIKEECDRE EVLAVAKLAR RCLSLNSEHR PTMRDVFIEL DRMQSKRKGT QSQAQNGEEH AHIQIAMPES MSLSYSSPNI 701: VVENSSFSLD TKPLMPHKTQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)