AT1G01460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.937 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Type I phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, subfamily A. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PIPK11; FUNCTIONS IN: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity, phosphatidylinositol phosphate kinase activity; INVOLVED IN: phosphatidylinositol metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: sperm cell, sepal, male gametophyte, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core, subgroup (InterPro:IPR016034), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core (InterPro:IPR002498); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol phosphate kinase 10 (TAIR:AT4G01190.1); Has 2109 Blast hits to 1621 proteins in 223 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 980; Fungi - 317; Plants - 416; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 394 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:169115..171154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48551.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 427 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFTREITAKD VKATEKNRIR YSSKHIKHLP PGTITEFEWK DYCPLGFRLI QELEDINHDE YMKSICNDET LRKLSTSKVG NMFLLSKDDR FLIKILRKSE 101: IKVILEMLPG YFRHIHKYRS TLLSKNYGAH SVKPIGGVKT YFVVMSNILQ SDVFMNKVYD LKGSSQGRTN KKIKVRDKTI LKDIDLDFCF YVDSLARHRL 201: IKQTKLDCEL LEDEGIMDYS LMLGLQVKGS CHGSIDELIP VYDSFTSRGS VDSNSSKFMK TASNSPDRSS STMYSCTPSR NSVDSENSVN IQSVASISPS 301: PAQTNASDSP YESLVSKTNL TNIFQNSSST NFGMKIPGRA RRVGRGESGS VVGKQSREGG EEWYDVILYL GIIDIFQDYG VRKRLEHCYK SIQHSSKTIS 401: AVHPKMYSSR FQDFVSQIFL PDEDPSH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)