AT2G38040.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acetyl Co-enzyme a carboxylase carboxyltransferase alpha subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes the carboxyltransferase alpha subunit of acetyl-CoA carboxylase, involved in de novo fatty acid biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acetyl Co-enzyme a carboxylase carboxyltransferase alpha subunit (CAC3); FUNCTIONS IN: acetyl-CoA carboxylase activity; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: acetyl-CoA carboxylase complex, chloroplast, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit, conserved region (InterPro:IPR020582), Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit (InterPro:IPR001095), Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR011763); Has 39620 Blast hits to 29201 proteins in 2891 species: Archae - 603; Bacteria - 9663; Metazoa - 14634; Fungi - 2688; Plants - 1525; Viruses - 82; Other Eukaryotes - 10425 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15917612..15920749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85310.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 769 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASISHSSLA LGGASSASAS DYLRSSSNGV NGVPLKTLGR AVFTTIRRKD LAVTSRLKKG KKFEHPWPAN PDPNVKGGVL SYLAEFKPLG DTQKPVTLDF 101: EKPLVELEKK IVDVRKMANE TGLDFTEQII TLENKYRQAL KDLYTHLTPI QRVNIARHPN RPTFLDHIHN ITDKFMELHG DRAGYDDPAI VTGIGTIDGK 201: RYMFIGHQKG RNTKENIMRN FGMPTPHGYR KALRMMYYAD HHGFPIVTFI DTPGAYADLK SEELGQGEAI ANNLRTMFGL KVPILSIVIG EGGSGGALAI 301: GCANKMLMLE NAVFYVASPE ACAAILWKTS KAAPEAAEKL RITSKELVKL NVADGIIPEP LGGAHADPSW TSQQIKIAIN ENMNEFGKMS GEELLKHRMA 401: KYRKIGVFIE GEPIEPSRKI NMKKREAVFS DSRKLQGEVD KLKEQILKAK ETSTEAEPSS EVLNEMIEKL KSEIDDEYTE AAIAVGLEER LTAMREEFSK 501: ASSEEHLMHP VLIEKIEKLK EEFNTRLTDA PNYESLKSKL NMLRDFSRAK AASEATSLKK EINKRFQEAV DRPEIREKVE AIKAEVASSG ASSFDELPDA 601: LKEKVLKTKG EVEAEMAGVL KSMGLELDAV KQNQKDTAEQ IYAANENLQE KLEKLNQEIT SKIEEVVRTP EIKSMVELLK VETAKASKTP GVTEAYQKIE 701: ALEQQIKQKI AEALNTSGLQ EKQDELEKEL AAARELAAEE SDGSVKEDDD DDEDSSESGK SEMVNPSFA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)